Sau khi đến Quincy thuộc vùng đất Illinois, bà Martha cùng Augustus Tolton và Charley bắt đầu làm việc tại Công ty thuốc lá Herris chuyên về các loại xì gà. Sau khi người thân trong gia đình là Charley qua đời dù còn rất trẻ, Augustus Tolton quyết định đến gặp linh mục Peter McGirr. Ông Peter McGirr là một linh mục nhập cư Ailen, từ Fintona, County Tyrone. Ông là người đã cho Augustus Tolton cơ hội để đi học tại giáo xứ Thánh Phêrô trong những tháng mùa đông khi nhà máy thuốc lá anh đang làm bị đóng cửa. Quyết định cho Augustus Tolton đi học của linh mục Peter McGirr đã gây tranh cãi rất nhiều trong giáo xứ của ông. Mặc dù chủ nghĩa bãi nô đã hoạt động khắp trong thị trấn, nhưng nhiều giáo dân của linh mục Peter McGirr đã phản đối việc để một học sinh da đen học chung trường cùng với các con em của họ. Tuy nhiên, linh mục Peter McGirr đã sắp xếp nhanh chóng mọi thứ và cho phép Augustus Tolton được vẫn tiếp tục học tập ở trường.

Mặc dù linh mục Peter McGirr đã tích cực giới thiệu Augustus Tolton vào một chủng viện của Hoa Kỳ, nhưng anh vẫn bị từ chối. Vì rất ấn tượng bởi những phẩm chất cá nhân tốt đẹp của Augustus Tolton, Peter McGirr lại tiếp tục giúp Augustus Tolton đi học và thực hiện các nghiên cứu tại Rome. Augustus Tolton sau đó đã tốt nghiệp tại trường St. Francis Solanus College và học tại Đại học Giáo hoàng Urbaniana. Tại đây, ông có thể vận dụng hoàn hảo để nói chuyện thành thạo cả bốn thứ tiếng: Mỹ, Ý, Hy Lạp và tiếng tiếng Latin.